More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0147 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  100 
 
 
464 aa  938    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.03 
 
 
460 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  48.38 
 
 
461 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0239  sugar transferase  52.55 
 
 
472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1875  sugar transferase  61.47 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  45.39 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.27 
 
 
464 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.22 
 
 
496 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2680  sugar transferase  44.85 
 
 
474 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0796334  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  42.07 
 
 
469 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5198  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.26 
 
 
465 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  55.25 
 
 
393 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  38.89 
 
 
466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  46.96 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.5 
 
 
465 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  46.23 
 
 
465 aa  330  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.54 
 
 
454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.56 
 
 
472 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.85 
 
 
466 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.35 
 
 
466 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48.8 
 
 
468 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48.96 
 
 
464 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.74 
 
 
464 aa  316  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  45.74 
 
 
464 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  45.74 
 
 
464 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.74 
 
 
464 aa  316  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.74 
 
 
464 aa  316  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.34 
 
 
464 aa  315  8e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.48 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.22 
 
 
464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  47.13 
 
 
466 aa  310  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.95 
 
 
460 aa  306  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.99 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  50 
 
 
469 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0310  sugar transferase  39.52 
 
 
454 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3231  sugar transferase  44.51 
 
 
469 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143756  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48 
 
 
464 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48 
 
 
464 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48 
 
 
464 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48 
 
 
464 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48 
 
 
464 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3172  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.87 
 
 
474 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.247578  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.27 
 
 
468 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  39.86 
 
 
477 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.44 
 
 
468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  42.29 
 
 
464 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.82 
 
 
467 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.83 
 
 
460 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  40.83 
 
 
460 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.83 
 
 
460 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.8 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  41.05 
 
 
460 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.5 
 
 
505 aa  269  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.29 
 
 
477 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.12 
 
 
471 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.48 
 
 
459 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  41.57 
 
 
457 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  39.51 
 
 
465 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.91 
 
 
471 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.51 
 
 
465 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  44.86 
 
 
484 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  45.37 
 
 
468 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.15 
 
 
518 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.15 
 
 
536 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3529  capsular polysaccharide biosynthesis protein PslA  39.95 
 
 
478 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.19 
 
 
473 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.5 
 
 
506 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.62 
 
 
472 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  39.06 
 
 
471 aa  259  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3301  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.21 
 
 
478 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.82 
 
 
461 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.21 
 
 
471 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.43 
 
 
461 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  40.26 
 
 
456 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3010  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.43 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.01 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  40.23 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  41.01 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  41.01 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.4 
 
 
517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.34 
 
 
473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  36.4 
 
 
459 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  37.02 
 
 
512 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.52 
 
 
445 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.47 
 
 
346 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.86 
 
 
506 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.41 
 
 
491 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.26 
 
 
468 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.76 
 
 
475 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  39.29 
 
 
460 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.5 
 
 
512 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.29 
 
 
460 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.29 
 
 
460 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.29 
 
 
461 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  34.26 
 
 
461 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.42 
 
 
518 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  39.29 
 
 
460 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2816  sugar transferase  42.08 
 
 
463 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2682  sugar transferase  41.95 
 
 
514 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  39.29 
 
 
460 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>