More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0108 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  100 
 
 		 481 aa  952    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  57.98 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  58.06 
 
 		 480 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  55.62 
 
 		 480 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  55.62 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  55.83 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  55.21 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  55.62 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  55.21 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  55.42 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  55 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  55.19 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  55.19 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  57.17 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  54.72 
 
 		 481 aa  508  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  57.11 
 
 		 494 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  53.75 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  49.44 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  49.44 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  49.44 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  51.19 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  48.92 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  46.62 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  48.8 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  47.06 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  45.95 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  40.09 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  41.61 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  44.21 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  42.06 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  41.77 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  39.46 
 
 		 454 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  39.73 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  38.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  40.54 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  40.47 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  39.41 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  38.17 
 
 		 454 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  39.02 
 
 		 454 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  38.88 
 
 		 454 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  38.64 
 
 		 454 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  38.64 
 
 		 454 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  39.02 
 
 		 455 aa  316  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  38.88 
 
 		 454 aa  315  8e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  40.71 
 
 		 453 aa  315  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  38.88 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  38.88 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  40.87 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  38.88 
 
 		 454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  38.41 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  37.7 
 
 		 454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  39.07 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  37.24 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  40.28 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  38.97 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  38.59 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  39.33 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  38.52 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  39.06 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  37.42 
 
 		 492 aa  282  8.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  35.39 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  39 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  38.85 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  34.37 
 
 		 445 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 446 aa  269  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  34.84 
 
 		 445 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  34.78 
 
 		 473 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  35.22 
 
 		 473 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  36.88 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  36.09 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  36.09 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  32.54 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  35 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  37.12 
 
 		 471 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  36.02 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  36.32 
 
 		 471 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  37.83 
 
 		 470 aa  249  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  38.03 
 
 		 463 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  33.81 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  34.88 
 
 		 482 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  36.41 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  35.11 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  34.99 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  36.71 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  34.37 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  36.95 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  34.52 
 
 		 454 aa  243  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  32.04 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  33.94 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  33.49 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  34.29 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  35.96 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.89 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  33.49 
 
 		 456 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  33.49 
 
 		 456 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  34.35 
 
 		 472 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  35.57 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  33.87 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  33.48 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  34.41 
 
 		 445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>