More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0083 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  100 
 
 
305 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  37.46 
 
 
287 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 
284 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  34.54 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  37.34 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
283 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.85 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  33 
 
 
280 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36 
 
 
282 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
286 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
278 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  37.44 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.92 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
330 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
328 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 
1012 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  31.2 
 
 
377 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  32.84 
 
 
365 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 
261 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
276 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
275 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  28.89 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1690  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
319 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  29.02 
 
 
318 aa  95.5  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.97 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.79 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4278  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.150732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  35.76 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  30.43 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  31.55 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  28.63 
 
 
310 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  35.53 
 
 
311 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  27.82 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  30.23 
 
 
559 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  28.32 
 
 
317 aa  87  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  34 
 
 
313 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 
306 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  31.46 
 
 
310 aa  85.5  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
292 aa  85.5  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  34 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  26.94 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  25.87 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  31.79 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  41.58 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.26 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4613  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000005749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  36.81 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  29.1 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.42 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.41 
 
 
485 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.12 
 
 
265 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
271 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  30.58 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  23.5 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
426 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.7 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.7 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
237 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  26.9 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.13 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.95 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.95 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.95 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  34.62 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  33.73 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.05 
 
 
395 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.74 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.75 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.81 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>