31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0080 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0080  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.523588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0184  hypothetical protein  33.57 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1631  hypothetical protein  30.98 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0386768 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1185  metal ion efflux membrane fusion protein family  35.81 
 
 		 354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1298  putative multidrug resistant protein  32.3 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2878  hypothetical protein  31.62 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0688135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3708  hypothetical protein  31.62 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000492742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3341  hypothetical protein  31.29 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4981  hypothetical protein  31.13 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  0.161388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4521  hypothetical protein  31.13 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.535871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5033  hypothetical protein  31.05 
 
 		 368 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.317146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3109  hypothetical protein  27.56 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 459 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.26 
 
 		 579 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2152  RND family efflux transporter MFP subunit  31.88 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  36.92 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 399 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 		 579 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  31.82 
 
 		 514 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.81 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 581 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.43 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 551 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 		 569 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.07 
 
 		 579 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 		 459 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.75 
 
 		 446 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  33.75 
 
 		 446 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7202  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.56 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  25 
 
 		 561 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>