More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0079 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1028 aa  2011    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  49.71 
 
 		 1064 aa  853    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  51.66 
 
 		 1061 aa  887    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  49.61 
 
 		 1064 aa  863    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  51.07 
 
 		 1054 aa  910    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  49.9 
 
 		 1064 aa  865    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  50.78 
 
 		 1039 aa  919    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  50.34 
 
 		 1032 aa  940    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  50.53 
 
 		 1046 aa  984    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  48.53 
 
 		 1052 aa  906    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  47.56 
 
 		 1055 aa  778    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  38.45 
 
 		 1045 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 		 1054 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.33 
 
 		 1092 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  34.74 
 
 		 1039 aa  589  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  33.37 
 
 		 1071 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  36.09 
 
 		 1034 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  36.35 
 
 		 1041 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  36.54 
 
 		 1050 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.44 
 
 		 1043 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  34.05 
 
 		 1066 aa  572  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  34.05 
 
 		 1066 aa  572  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  36.74 
 
 		 1036 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.33 
 
 		 1061 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  36.86 
 
 		 1023 aa  562  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.27 
 
 		 1053 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.12 
 
 		 1034 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 		 1031 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  37.52 
 
 		 1043 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  40.8 
 
 		 1033 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 		 1058 aa  552  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.58 
 
 		 1049 aa  548  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.53 
 
 		 1054 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  39.88 
 
 		 1030 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.35 
 
 		 1048 aa  545  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  37.13 
 
 		 1066 aa  545  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  36.28 
 
 		 1047 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.57 
 
 		 1049 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 		 1058 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.13 
 
 		 1037 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.99 
 
 		 1049 aa  535  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  36.85 
 
 		 1049 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  36.14 
 
 		 1040 aa  534  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.45 
 
 		 1037 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 		 1044 aa  526  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  35.95 
 
 		 1057 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.57 
 
 		 1026 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1052 aa  516  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  35.16 
 
 		 1043 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  34.86 
 
 		 1075 aa  512  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  36.83 
 
 		 1047 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.3 
 
 		 1039 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.3 
 
 		 1039 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  33.14 
 
 		 1039 aa  495  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.56 
 
 		 1039 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  41.15 
 
 		 1034 aa  493  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.82 
 
 		 1039 aa  493  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  34.7 
 
 		 1032 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  31.23 
 
 		 1040 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.75 
 
 		 1039 aa  485  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.18 
 
 		 1043 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  33.3 
 
 		 1033 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  31.83 
 
 		 1049 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  32.82 
 
 		 1039 aa  478  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  32.01 
 
 		 1039 aa  479  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  32.81 
 
 		 1029 aa  476  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  31.4 
 
 		 1037 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  32.15 
 
 		 1031 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.63 
 
 		 1064 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  34.53 
 
 		 1032 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.35 
 
 		 1020 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.11 
 
 		 1048 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  31.06 
 
 		 1052 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.66 
 
 		 1051 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  32.06 
 
 		 1059 aa  466  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  32.22 
 
 		 1077 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  32.1 
 
 		 1051 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  32.22 
 
 		 1077 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  32.22 
 
 		 1077 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  32.75 
 
 		 1023 aa  466  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  32.13 
 
 		 1077 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  32.13 
 
 		 1077 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  33.36 
 
 		 1060 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  32.4 
 
 		 1054 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  32.13 
 
 		 1077 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  32.13 
 
 		 1077 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  31.37 
 
 		 1053 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.55 
 
 		 1034 aa  459  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.51 
 
 		 1049 aa  459  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  31.63 
 
 		 1062 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.92 
 
 		 1022 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.29 
 
 		 1062 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  31.65 
 
 		 1070 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  31.05 
 
 		 1054 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  31.39 
 
 		 1083 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  31.65 
 
 		 1070 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  31.16 
 
 		 1053 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  31.16 
 
 		 1053 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  31.65 
 
 		 1070 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  31.65 
 
 		 1070 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>