147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0070 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0070  Na/Pi-cotransporter family protein  100 
 
 
536 aa  1043    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0740  Na+/Picotransporter  28.6 
 
 
551 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.36348  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.35 
 
 
541 aa  108  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  26.93 
 
 
559 aa  106  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.99 
 
 
541 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.06 
 
 
541 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  25 
 
 
537 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.64 
 
 
567 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  25.36 
 
 
537 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.23 
 
 
576 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  26.16 
 
 
535 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.9 
 
 
541 aa  100  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.3 
 
 
564 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.8 
 
 
643 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  27.68 
 
 
555 aa  98.6  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.26 
 
 
538 aa  95.9  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2528  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
549 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  21.91 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.83 
 
 
564 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  23.34 
 
 
551 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.78 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  22.53 
 
 
551 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  23.05 
 
 
551 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.32 
 
 
304 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.56 
 
 
556 aa  87.4  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  23.05 
 
 
544 aa  87  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  22.73 
 
 
551 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  22.73 
 
 
551 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  22.73 
 
 
551 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  22.73 
 
 
551 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.32 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  22.73 
 
 
551 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  22.48 
 
 
551 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.99 
 
 
566 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.22 
 
 
555 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.22 
 
 
555 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  25.44 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  25.44 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  21.32 
 
 
559 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24 
 
 
549 aa  80.1  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  28.07 
 
 
547 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  21.4 
 
 
590 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  24.09 
 
 
557 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  24.63 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.43 
 
 
587 aa  77.8  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  28.43 
 
 
548 aa  77.4  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2701  Na+/Pi-cotransporter  24.2 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.81 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  26.8 
 
 
556 aa  74.7  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.22 
 
 
548 aa  74.3  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  23.89 
 
 
592 aa  74.3  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.02 
 
 
556 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  21.58 
 
 
563 aa  73.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  24.71 
 
 
586 aa  73.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0543  Na+/Pi-cotransporter  25.78 
 
 
616 aa  73.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  23.94 
 
 
562 aa  72  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.58 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.31 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.53 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.61 
 
 
556 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.61 
 
 
556 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.58 
 
 
558 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  27.92 
 
 
566 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.32 
 
 
536 aa  70.1  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1943  Na+/Pi-cotransporter  22.83 
 
 
584 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  25.4 
 
 
600 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.91 
 
 
552 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.14 
 
 
552 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1106  Na+/Pi-cotransporter  25.2 
 
 
593 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.174638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.3 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.22 
 
 
584 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.05 
 
 
636 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  26.27 
 
 
561 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.99 
 
 
552 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0962  Na+/Pi-cotransporter  23.96 
 
 
578 aa  65.1  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.126514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0199  Na+/Picotransporter  27.73 
 
 
303 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  29.53 
 
 
542 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  22.73 
 
 
570 aa  64.7  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  21.45 
 
 
556 aa  64.7  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.93 
 
 
552 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1012  Na+/Pi-cotransporter  26.59 
 
 
308 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.65 
 
 
559 aa  63.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  21.69 
 
 
539 aa  63.2  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  23.04 
 
 
549 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.33 
 
 
577 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.81 
 
 
318 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  22.42 
 
 
549 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  24.68 
 
 
550 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  27.03 
 
 
559 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.48 
 
 
311 aa  57  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.13 
 
 
548 aa  57  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  26.57 
 
 
548 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4194  Na+/Pi-cotransporter  23.73 
 
 
613 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  27.24 
 
 
289 aa  54.3  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  26.24 
 
 
554 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.5 
 
 
565 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.06 
 
 
548 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.3 
 
 
570 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  28.12 
 
 
548 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0628  Na/Pi-cotransporter, putative  21.7 
 
 
550 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>