More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0064 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  890    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  52.45 
 
 		 434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  51.21 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  45.24 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  47.72 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  44.95 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  46.3 
 
 		 429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  42.92 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  42.03 
 
 		 434 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  41.8 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  42.69 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  45.78 
 
 		 481 aa  343  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  47.57 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  42 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  39.72 
 
 		 441 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  42.4 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  41.67 
 
 		 495 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  41.69 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  42.23 
 
 		 486 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  41.61 
 
 		 494 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  41.91 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  42.2 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  41.91 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  41.77 
 
 		 494 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  40.69 
 
 		 495 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  43.46 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  40.44 
 
 		 495 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  42.69 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  43.75 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  41.55 
 
 		 454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  43.51 
 
 		 450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  41.18 
 
 		 496 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  40.69 
 
 		 496 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  42.13 
 
 		 453 aa  309  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  41.55 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  41.95 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  42.32 
 
 		 453 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  42.12 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  41.46 
 
 		 451 aa  289  8e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  40.93 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  36.97 
 
 		 445 aa  286  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  37.42 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  37.06 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  34.72 
 
 		 504 aa  266  7e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  34.44 
 
 		 528 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  33.73 
 
 		 515 aa  249  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  35.11 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  32.1 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  32.69 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  32.26 
 
 		 465 aa  216  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  33.09 
 
 		 464 aa  216  9e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  32.32 
 
 		 477 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 		 451 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  34.63 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  32.45 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  31.72 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  32.27 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  31.28 
 
 		 437 aa  206  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  33.25 
 
 		 435 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  33.01 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  32.94 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  30.8 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  31.23 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  32.95 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  33.18 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  31.99 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  30.91 
 
 		 464 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  31.91 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  32.09 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  33.08 
 
 		 431 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  32.92 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  30.36 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  32.09 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  30.63 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  29.36 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  31.59 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  30.24 
 
 		 495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  30 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  31.83 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  29.91 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  29.03 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  30.07 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  28.84 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  31.11 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  30.63 
 
 		 474 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.47 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  30.45 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  29.36 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  30.23 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  29.22 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  27.49 
 
 		 482 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  29.22 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  29.14 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  28.9 
 
 		 767 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  29.16 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  29.34 
 
 		 921 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>