16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0060 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0060  general secretion pathway protein B, putative  100 
 
 		 269 aa  524  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  28.62 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1086  general secretion pathway protein B  22.05 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.970223  hitchhiker  0.0086707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  24.05 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  26.19 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  26.19 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  24.53 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0789  hypothetical protein  29.85 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  25 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  25 
 
 		 372 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  25 
 
 		 372 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  22.67 
 
 		 415 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0082  hypothetical protein  34.72 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000224621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1147  hypothetical protein  24.65 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  28.77 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>