268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0043 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  100 
 
 
142 aa  294  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  59.86 
 
 
143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  60.28 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  49.66 
 
 
146 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1747  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  47.1 
 
 
145 aa  135  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50 
 
 
147 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.86 
 
 
143 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  46.43 
 
 
149 aa  134  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  45.99 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  51.41 
 
 
155 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  44.29 
 
 
148 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  49.28 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  48.61 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.39 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  45 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3821  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.99 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0187638  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.23 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  44.68 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  44.68 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  47.86 
 
 
148 aa  128  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1026  ribose 5-phosphate isomerase B  47.86 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
370 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  49.64 
 
 
148 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  48.2 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  48.18 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  43.57 
 
 
322 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  42.25 
 
 
148 aa  124  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.97 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  42.14 
 
 
143 aa  124  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12150  ribose-5-phosphate isomerase  44.29 
 
 
144 aa  124  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.29 
 
 
154 aa  123  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.37 
 
 
146 aa  122  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  50.36 
 
 
155 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  46.1 
 
 
149 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  46.1 
 
 
149 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  48.2 
 
 
159 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  46.1 
 
 
149 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  45.83 
 
 
162 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  48.2 
 
 
161 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  46.1 
 
 
149 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  48.2 
 
 
149 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  40.88 
 
 
149 aa  121  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  40.43 
 
 
145 aa  121  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.26 
 
 
142 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  47.92 
 
 
161 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.14 
 
 
147 aa  120  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  42.36 
 
 
155 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4874  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.6 
 
 
143 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.85 
 
 
152 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.07 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  45.07 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  45.07 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  42.36 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  44.68 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  41.3 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.43 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  47.55 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  47.86 
 
 
160 aa  118  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.57 
 
 
140 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.85 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1162  ribose-5-phosphate isomerase B  45.14 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0742632  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0842  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.26 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  40.43 
 
 
144 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.86 
 
 
153 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  42.96 
 
 
148 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2734  ribose 5-phosphate isomerase B  45.04 
 
 
147 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  45.32 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  45.32 
 
 
149 aa  116  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  41.13 
 
 
150 aa  116  7.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  44.6 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  42.75 
 
 
147 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  42.75 
 
 
147 aa  116  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  42.75 
 
 
147 aa  116  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  42.75 
 
 
147 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  42.75 
 
 
147 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.57 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  42.03 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.65 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  43.38 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  44.12 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  42.03 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.57 
 
 
148 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.96 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.71 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  42.03 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  41.3 
 
 
147 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.07 
 
 
150 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  40.58 
 
 
162 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  48.2 
 
 
150 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  44.6 
 
 
155 aa  114  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  41.13 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  44.37 
 
 
149 aa  114  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  46.76 
 
 
155 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0682  ribose 5-phosphate isomerase B  42.55 
 
 
145 aa  114  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  41.3 
 
 
147 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  46.04 
 
 
152 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.71 
 
 
149 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  46.76 
 
 
157 aa  114  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  40.43 
 
 
148 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>