215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0032 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0032  ISMca6, transposase, OrfB  100 
 
 
197 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1610  ISMca6, transposase, OrfB  98.98 
 
 
197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  31.69 
 
 
372 aa  81.3  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  32.61 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3310  ISMca6, transposase, OrfB  36.23 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  32.57 
 
 
367 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  30.86 
 
 
373 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
483 aa  68.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5630  transposase ISAs1 family protein  45.31 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000338804 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5832  transposase ISAs1 family protein  45.31 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3911  transposase ISAs1 family protein  45.31 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5401  transposase ISAs1 family protein  45.31 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5528  transposase ISAs1 family protein  45.31 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0898729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  44.78 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5802  transposase ISAs1 family protein  45.31 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5649  transposase ISAs1 family protein  45.31 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  44.78 
 
 
377 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  31.52 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  43.75 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  27.84 
 
 
378 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  43.75 
 
 
393 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2993  H repeat-containing protein  45.31 
 
 
114 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.937922  normal  0.482071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4877  H repeat-containing protein  45.31 
 
 
114 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  27.84 
 
 
378 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0593  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 
287 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 
378 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 
378 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  30.49 
 
 
390 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  27.27 
 
 
378 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  42.27 
 
 
390 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  42.27 
 
 
390 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  42.27 
 
 
390 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0246  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
367 aa  62  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 
378 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
388 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
388 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
388 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
388 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
388 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
388 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
388 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  28.98 
 
 
378 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  28.9 
 
 
378 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  28.9 
 
 
378 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  27.27 
 
 
378 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
378 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  27.27 
 
 
378 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1061  ISPg6, transposase  27.27 
 
 
362 aa  60.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  28.98 
 
 
378 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4269  transposase IS4 family protein  44.59 
 
 
342 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  27.06 
 
 
373 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3492  hypothetical protein  47.69 
 
 
375 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>