64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0005 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  100 
 
 		 123 aa  241  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  51.81 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  47.44 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  47.44 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  43.28 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  37.5 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  35.34 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  36.63 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  43.33 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  43.33 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  35.77 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  42.22 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  34.43 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  42.22 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  36.36 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  33.61 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  33.61 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  34.43 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  42.68 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  33.64 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  45.12 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  45.12 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  32.79 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  33.61 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  32.79 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  32.79 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  40.74 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  40.74 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  41.43 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  40.74 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  40.74 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  36.14 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  30.36 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  30.63 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  37.35 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  45.12 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  36.14 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  36.05 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4107  ATP synthase protein I  32.76 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.09604e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  37.66 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  40.24 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  29.91 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  33.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  33.65 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  30.53 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  32.32 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  36.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  36.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  36.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  36.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  36.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  36.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  36.14 
 
 		 176 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  30.77 
 
 		 183 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  34.94 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  39.74 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  34.41 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  34.94 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4469  ATP synthase I chain  41.86 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000279802  hitchhiker  0.00000000148592 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  34.94 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  34.94 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06111  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>