More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0004 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  100 
 
 		 282 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  53.95 
 
 		 292 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  56.25 
 
 		 289 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  52.22 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  54.06 
 
 		 286 aa  292  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  52.98 
 
 		 290 aa  291  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  54.64 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  52.22 
 
 		 294 aa  288  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  52.22 
 
 		 292 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  52.22 
 
 		 292 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  52.22 
 
 		 292 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  52.22 
 
 		 292 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  52.22 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  51.88 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  51.88 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  52.22 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  51.55 
 
 		 292 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  50.85 
 
 		 296 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  52.76 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  51.74 
 
 		 290 aa  282  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  51.74 
 
 		 288 aa  282  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  54.67 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  54.67 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  50.85 
 
 		 294 aa  278  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  49.5 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  53.82 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  53.12 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  54.7 
 
 		 290 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  51.9 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  55.02 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  54.17 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  52.74 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  51.32 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  53.38 
 
 		 286 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  52.74 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  50.52 
 
 		 295 aa  268  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  55.28 
 
 		 287 aa  268  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  51.74 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  51.23 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  51.39 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  51.88 
 
 		 297 aa  262  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  51.06 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  49.83 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  49.31 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  51.06 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  49.48 
 
 		 303 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  49.33 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  49.49 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  49.83 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  48.98 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  49.3 
 
 		 295 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  48.46 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  47.93 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  46.8 
 
 		 293 aa  248  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  49.31 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  49.31 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  49.31 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  49.65 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  49.65 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  49.65 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  49.65 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  49.65 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  49.65 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  49.65 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  48.96 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  48.61 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  52.14 
 
 		 284 aa  241  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  45.42 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  48.24 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  44.75 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  48.48 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  48.48 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  46.76 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  51.4 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  51.25 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  49.31 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  47.68 
 
 		 303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  48.96 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  48.26 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  50.52 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  46.41 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  46.1 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  45.36 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.55 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.05 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  47.28 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  46.94 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  46.93 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  44.65 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  45.7 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  44.32 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  44.63 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0050  parB-like partition protein  44.34 
 
 		 331 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383845  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  43.46 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  45.92 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  45.34 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  47.81 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  47.81 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  47.08 
 
 		 296 aa  214  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>