278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf883 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  100 
 
 		 48 aa  97.1  8e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  74.47 
 
 		 50 aa  73.2  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 52 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  70.83 
 
 		 51 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 52 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  74.47 
 
 		 47 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  72.92 
 
 		 48 aa  68.6  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  72.92 
 
 		 55 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  68.89 
 
 		 52 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  72.34 
 
 		 52 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  68.75 
 
 		 52 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  75 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 53 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 53 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  71.74 
 
 		 53 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 52 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 53 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0767  ribosomal protein L34  63.83 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  71.11 
 
 		 46 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  67.39 
 
 		 53 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 45 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 45 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 51 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  68.09 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  65.22 
 
 		 53 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  68.89 
 
 		 46 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 51 aa  61.2  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2400  50S ribosomal protein L34  64.58 
 
 		 51 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.84341  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1043  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000531959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_914  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000254245  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 46 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  70.45 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1194  ribosomal protein L34  61.7 
 
 		 57 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000642694  decreased coverage  0.000208827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0926  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 46 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320545  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 47 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  65.12 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  59.09 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  57.45 
 
 		 53 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0553  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  69.05 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  56.25 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>