286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf790 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf790  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  284  4e-76  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 
159 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 
159 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  41.83 
 
 
154 aa  103  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  36.88 
 
 
159 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  38.12 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  42.86 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
177 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
159 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  37.74 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  35 
 
 
160 aa  92  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  34.39 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
162 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  89  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
159 aa  87  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 
167 aa  87  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 
167 aa  87  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  30.77 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  31.85 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
156 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000256643  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 
156 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000163704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
156 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
156 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
156 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
156 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000535521  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  29.68 
 
 
156 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000336055  unclonable  0.0000000000393257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  31.61 
 
 
155 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  36.65 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  40.52 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  30 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  48.81 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.12 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  32.26 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  34.21 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  29.68 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000354968  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  29.68 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000270066  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  30.26 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  27.74 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000116859  decreased coverage  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  29.61 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  27.63 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  27.74 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  30.57 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  28.39 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  31.82 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  30.82 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1136  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00404994  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  30.92 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4518  protein of unknown function DUF163  29.73 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.600852  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  29.61 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  29.3 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  30.26 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  29.03 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  27.1 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  28.39 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  29.38 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  32.45 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>