191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf696 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf696  ribosomal protein S6  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0927  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1087  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000589418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  29.45 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2133  30S ribosomal protein S6  27.63 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  30.32 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  34.07 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  29.27 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  30.83 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1057  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.66834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  28.91 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 124 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 119 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  26.83 
 
 		 119 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 120 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl080  30S ribosomal protein S6  27.13 
 
 		 290 aa  50.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  1.25992e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 125 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  30.85 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  28.67 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  28.42 
 
 		 96 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1550  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1433  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0645  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.501453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65180  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5662  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>