More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf440 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  67.62 
 
 		 281 aa  400  9.999999999999999e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  68.35 
 
 		 281 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 277 aa  390  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  68.1 
 
 		 277 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  68.1 
 
 		 277 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  64.87 
 
 		 277 aa  381  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  67.38 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  68.1 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0229  50S ribosomal protein L2  65.23 
 
 		 279 aa  378  1e-104  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.116801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  64.16 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  65.95 
 
 		 276 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  63.31 
 
 		 281 aa  360  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  64.03 
 
 		 277 aa  359  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  61.01 
 
 		 276 aa  343  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 277 aa  343  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 277 aa  343  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  341  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  59.79 
 
 		 278 aa  341  9e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 		 276 aa  332  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 		 275 aa  331  8e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 		 276 aa  331  9e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  57.71 
 
 		 276 aa  328  8e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  56.63 
 
 		 276 aa  326  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 281 aa  325  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  57.71 
 
 		 276 aa  324  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  58.27 
 
 		 275 aa  322  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  56.94 
 
 		 280 aa  320  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 		 275 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  56.63 
 
 		 275 aa  313  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  57.19 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 275 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 278 aa  309  4e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 		 275 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  56.68 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  54.29 
 
 		 287 aa  305  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 275 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  52.5 
 
 		 287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  55.76 
 
 		 275 aa  303  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0062  50S ribosomal protein L2  56.27 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000124196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 		 274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  57.35 
 
 		 276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  55.76 
 
 		 275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  54.64 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  54.15 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  53.79 
 
 		 274 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  53.41 
 
 		 283 aa  301  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  55.11 
 
 		 287 aa  301  7.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 276 aa  301  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1701  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 276 aa  301  8.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  53.79 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2078  50S ribosomal protein L2  55.2 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000477294  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  54.01 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  57.35 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  54.8 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  55.2 
 
 		 275 aa  298  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  51.43 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 287 aa  298  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  54.15 
 
 		 275 aa  298  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  55.87 
 
 		 277 aa  298  9e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  51.61 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  51.61 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000398645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  56.68 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  55.23 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 		 275 aa  295  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0436  50S ribosomal protein L2  54.68 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  54.58 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  54.64 
 
 		 279 aa  295  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>