160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf434 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 88 aa  176  8e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  44.07 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  52.73 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  39.47 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  45.71 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  49.09 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  49.09 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  47.27 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1867  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866901  hitchhiker  0.00000164935 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1696  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00133107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2073  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0466832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0067  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  47.06 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  44.64 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0688  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  51.06 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  42.03 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0497  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000428226  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0492  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000269132  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0042  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>