More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf277 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf277  transketolase  100 
 
 
623 aa  1265    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00408645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  30.88 
 
 
668 aa  290  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0610  transketolase  32.98 
 
 
656 aa  288  2e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0812266  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl349  transketolase  31.64 
 
 
655 aa  283  5.000000000000001e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.9216400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  30.11 
 
 
662 aa  277  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  30.11 
 
 
662 aa  277  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  29.5 
 
 
665 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  29.2 
 
 
659 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  28.81 
 
 
668 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  28.9 
 
 
659 aa  269  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  28.64 
 
 
679 aa  269  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  29.61 
 
 
662 aa  267  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  27.6 
 
 
666 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  30.14 
 
 
684 aa  259  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  27.6 
 
 
666 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  27.6 
 
 
666 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  27.6 
 
 
666 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  27.6 
 
 
666 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  27.6 
 
 
680 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  27.93 
 
 
653 aa  257  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  28.98 
 
 
662 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  27.3 
 
 
666 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  27.56 
 
 
680 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  28.55 
 
 
662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1169  transketolase  29.15 
 
 
640 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  27.7 
 
 
658 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  28.42 
 
 
671 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  27.93 
 
 
667 aa  254  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  26.96 
 
 
666 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  28.29 
 
 
668 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0690  transketolase  32.52 
 
 
654 aa  253  7e-66  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  27.63 
 
 
666 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  28.37 
 
 
661 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  27.71 
 
 
666 aa  250  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  29.86 
 
 
670 aa  250  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  29.11 
 
 
664 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  30.23 
 
 
670 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  28.98 
 
 
668 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  28.38 
 
 
666 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  28.61 
 
 
666 aa  248  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  28.61 
 
 
666 aa  248  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  28.18 
 
 
660 aa  247  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  28.44 
 
 
668 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  28.59 
 
 
668 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  25.98 
 
 
665 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  29.41 
 
 
664 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  27.48 
 
 
671 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  25.98 
 
 
665 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0131  transketolase  29.22 
 
 
666 aa  244  3e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  29.53 
 
 
669 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  29.41 
 
 
664 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  29 
 
 
664 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  29.41 
 
 
664 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  26.86 
 
 
668 aa  243  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  30.14 
 
 
670 aa  243  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  25.68 
 
 
665 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  29.56 
 
 
664 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  27.82 
 
 
684 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  30.06 
 
 
669 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  28.7 
 
 
668 aa  242  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1308  transketolase  28.04 
 
 
675 aa  241  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  28.55 
 
 
671 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  30.27 
 
 
664 aa  240  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  26.91 
 
 
668 aa  239  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  26.65 
 
 
691 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  27 
 
 
672 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  27.4 
 
 
669 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  28.72 
 
 
666 aa  237  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  26.94 
 
 
691 aa  237  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  26.94 
 
 
691 aa  237  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  29.24 
 
 
658 aa  237  6e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  25.45 
 
 
660 aa  236  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  30.51 
 
 
670 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  28.96 
 
 
657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  29.09 
 
 
669 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  27.64 
 
 
660 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  28.72 
 
 
674 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  28.27 
 
 
682 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  28.72 
 
 
674 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  28.97 
 
 
636 aa  234  5e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  28.79 
 
 
670 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  28.79 
 
 
670 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  28.06 
 
 
665 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  25.76 
 
 
665 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  28.49 
 
 
671 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  26.12 
 
 
688 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  26.32 
 
 
675 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  28.67 
 
 
695 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  25.47 
 
 
691 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  25.47 
 
 
691 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  26.76 
 
 
711 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  26.81 
 
 
667 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 
687 aa  230  5e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  24.62 
 
 
655 aa  230  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  26.45 
 
 
711 aa  230  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  29.77 
 
 
632 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  25.61 
 
 
661 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  28.41 
 
 
669 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  26.12 
 
 
691 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2740  transketolase  24.92 
 
 
659 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>