More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf192 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf192  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
171 aa  341  4e-93  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000290419  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0205  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 
181 aa  143  1e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl188  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 
180 aa  142  3e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.75747e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  41.61 
 
 
154 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  37.01 
 
 
190 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  44.97 
 
 
164 aa  121  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  39.87 
 
 
172 aa  121  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  39.72 
 
 
181 aa  120  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  41.38 
 
 
154 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  39.87 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
195 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
195 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
195 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
195 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  37.59 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  35.71 
 
 
166 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
166 aa  117  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  37.58 
 
 
182 aa  117  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  35.71 
 
 
166 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  37.66 
 
 
238 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0752  translation initiation factor IF-3  37.8 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  39.6 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  37.89 
 
 
250 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  40.27 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  36.77 
 
 
179 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2501  translation initiation factor IF-3  43.7 
 
 
145 aa  114  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.303571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  40.94 
 
 
176 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  42.04 
 
 
229 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  39.72 
 
 
173 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  40.82 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  40.82 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  40.43 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  40.82 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  33.33 
 
 
219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  37.5 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  40.6 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  35.71 
 
 
233 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  37.5 
 
 
243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
225 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  40.91 
 
 
168 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  37.74 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  40.43 
 
 
164 aa  111  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  41.84 
 
 
164 aa  111  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  34.62 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  38.62 
 
 
176 aa  110  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  38.89 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  39.31 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  38.26 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  36.88 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  36.08 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  34.48 
 
 
243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  37.18 
 
 
227 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  40.3 
 
 
222 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  42.48 
 
 
173 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  34.64 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  39.61 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  40.94 
 
 
176 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  34.5 
 
 
238 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  34.5 
 
 
238 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  34.5 
 
 
238 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  36.5 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  40 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1344  translation initiation factor IF-3  41.83 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000182733  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  40.3 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  38.3 
 
 
172 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  36.75 
 
 
415 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  37.58 
 
 
175 aa  106  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0680  translation initiation factor 3  38.26 
 
 
157 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000916638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  40.69 
 
 
153 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  39.44 
 
 
175 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  32.45 
 
 
179 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  34.84 
 
 
182 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  35.58 
 
 
179 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  36.65 
 
 
208 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  36.99 
 
 
329 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  38.35 
 
 
212 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  39.1 
 
 
401 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  40.6 
 
 
277 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  41.83 
 
 
173 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  37.82 
 
 
173 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  37.59 
 
 
169 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  41.13 
 
 
233 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  42.34 
 
 
171 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  39.35 
 
 
176 aa  105  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000188384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  36.6 
 
 
159 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  35.62 
 
 
195 aa  104  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  38.71 
 
 
176 aa  104  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  36.88 
 
 
198 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  37.86 
 
 
176 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  35.57 
 
 
154 aa  103  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  34.23 
 
 
173 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  35.46 
 
 
173 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  37.59 
 
 
176 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  34.9 
 
 
239 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  34.9 
 
 
204 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1443  translation initiation factor 3  34.75 
 
 
143 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000186833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>