More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf138 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  100 
 
 
327 aa  673    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  83.02 
 
 
329 aa  569  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  70.59 
 
 
338 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  66.05 
 
 
324 aa  435  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  41.52 
 
 
417 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  41.74 
 
 
318 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  42.63 
 
 
305 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  42.77 
 
 
416 aa  235  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  41.08 
 
 
320 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  40.6 
 
 
416 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.3 
 
 
328 aa  230  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  42.37 
 
 
311 aa  229  6e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  41.98 
 
 
417 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  40.79 
 
 
331 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  40.48 
 
 
727 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  40.48 
 
 
419 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  39.47 
 
 
415 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  38.42 
 
 
436 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  38.44 
 
 
424 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  37.84 
 
 
425 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  38.78 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  35.03 
 
 
657 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  37.76 
 
 
406 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  39.39 
 
 
417 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  35.59 
 
 
428 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  38.41 
 
 
323 aa  196  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  37.96 
 
 
336 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  37.93 
 
 
417 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.63 
 
 
418 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  37.97 
 
 
491 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  38.49 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  37.31 
 
 
487 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  35.99 
 
 
426 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  36.51 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  34.06 
 
 
476 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  36.01 
 
 
476 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  34.06 
 
 
476 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  34.06 
 
 
476 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  34.06 
 
 
476 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  36.79 
 
 
329 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  35.47 
 
 
472 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  35.2 
 
 
472 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  35.2 
 
 
472 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  35.2 
 
 
472 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  33.33 
 
 
350 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  35.2 
 
 
472 aa  175  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  35.2 
 
 
472 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  34.92 
 
 
472 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  34.45 
 
 
471 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  44.2 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  34.08 
 
 
313 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  35.56 
 
 
447 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  46.24 
 
 
438 aa  160  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  36.47 
 
 
437 aa  159  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
444 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.04 
 
 
328 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
335 aa  155  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  41.36 
 
 
460 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  41.36 
 
 
460 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.77 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  30.94 
 
 
495 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  42.93 
 
 
456 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  42.93 
 
 
456 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
423 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  40.1 
 
 
467 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  33.42 
 
 
372 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
423 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
350 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  31.59 
 
 
373 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  29.61 
 
 
315 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  41.57 
 
 
483 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.85 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  34.7 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 
368 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
323 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  31.52 
 
 
352 aa  122  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.11 
 
 
348 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.44 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  37.5 
 
 
239 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.27 
 
 
435 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
454 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 
490 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  39.09 
 
 
468 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 
321 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 
434 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  25.63 
 
 
313 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  26.75 
 
 
409 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.18 
 
 
431 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
393 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
337 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>