More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf113 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf113  glucose-inhibited division protein B  100 
 
 
173 aa  347  4e-95  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  31.37 
 
 
209 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  36.47 
 
 
237 aa  94  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  36.2 
 
 
238 aa  92.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  29.8 
 
 
208 aa  92  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  30.38 
 
 
211 aa  90.9  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  30.97 
 
 
234 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  29.89 
 
 
211 aa  89  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  36.94 
 
 
237 aa  87  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  36.47 
 
 
231 aa  86.7  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 
206 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  31.87 
 
 
225 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  29.3 
 
 
211 aa  84.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  30.26 
 
 
234 aa  84.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  30.87 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  31.87 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  31.01 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  27.38 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.9 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  32.75 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  32.68 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  38.62 
 
 
240 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  34.88 
 
 
239 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  34.78 
 
 
239 aa  82  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 
228 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  30.87 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 
227 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  35.42 
 
 
239 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  34.38 
 
 
242 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  32.53 
 
 
236 aa  80.9  0.000000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 
228 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 
228 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  28.86 
 
 
212 aa  80.9  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  32.92 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  32.92 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  35.42 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  35.33 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  29.45 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  37.74 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.3 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  29.3 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  29.3 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  29.3 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  30.32 
 
 
212 aa  79  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  31.07 
 
 
237 aa  79  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  29.38 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  34.29 
 
 
222 aa  79  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  27.38 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  26.75 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  33.57 
 
 
222 aa  77.8  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  29.68 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  31.76 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  32.26 
 
 
242 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  29.45 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 
240 aa  77.4  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30.82 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  31.51 
 
 
221 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  26.97 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30.82 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  31.51 
 
 
221 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  32.58 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  27.44 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  29.71 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  29.71 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  29.45 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  37.5 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  34.56 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  26.95 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  26.95 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  27.15 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  29.45 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  28.32 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  28.1 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  29.45 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  31.41 
 
 
214 aa  73.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>