More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf020 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  55.3 
 
 
666 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  53.46 
 
 
654 aa  674    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  53.99 
 
 
653 aa  678    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  53.3 
 
 
654 aa  671    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  53.3 
 
 
654 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  53.25 
 
 
647 aa  647    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  53.3 
 
 
654 aa  672    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  55.38 
 
 
665 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  100 
 
 
637 aa  1292    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  53.46 
 
 
654 aa  674    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  55.38 
 
 
663 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  53.46 
 
 
654 aa  668    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  53.3 
 
 
654 aa  671    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  53.49 
 
 
643 aa  657    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  53.3 
 
 
654 aa  672    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  55.16 
 
 
656 aa  690    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  53.46 
 
 
654 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  54.25 
 
 
674 aa  680    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  55.38 
 
 
645 aa  689    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  56.2 
 
 
644 aa  696    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  54.09 
 
 
674 aa  647    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  54.62 
 
 
661 aa  670    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  55.17 
 
 
649 aa  671    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  53.3 
 
 
654 aa  669    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  53.62 
 
 
654 aa  668    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  54.23 
 
 
642 aa  681    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  51.63 
 
 
687 aa  633  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.74 
 
 
636 aa  618  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.58 
 
 
636 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  49.28 
 
 
650 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  48.83 
 
 
645 aa  579  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  49.2 
 
 
640 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  46.99 
 
 
649 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.71 
 
 
641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  45.45 
 
 
647 aa  570  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.63 
 
 
633 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  46.71 
 
 
628 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  47.49 
 
 
648 aa  561  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  48.48 
 
 
636 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  48.95 
 
 
627 aa  556  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  49.2 
 
 
650 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  47.39 
 
 
632 aa  556  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  50.48 
 
 
637 aa  558  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  46.74 
 
 
644 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  47.96 
 
 
637 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  50.32 
 
 
641 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  46.41 
 
 
635 aa  549  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  47.24 
 
 
648 aa  550  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  49.6 
 
 
633 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  49.76 
 
 
640 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  48 
 
 
634 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  49.44 
 
 
640 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  47.71 
 
 
644 aa  544  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  47.1 
 
 
634 aa  543  1e-153  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  48.33 
 
 
635 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  49.2 
 
 
633 aa  543  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  47.39 
 
 
642 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  46.96 
 
 
637 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  47.14 
 
 
643 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.84 
 
 
642 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  46.83 
 
 
644 aa  541  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  47.78 
 
 
643 aa  538  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  47.69 
 
 
633 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  48.11 
 
 
649 aa  537  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  48.8 
 
 
638 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  44.14 
 
 
665 aa  534  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  45.09 
 
 
636 aa  532  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  47.3 
 
 
649 aa  534  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  46.26 
 
 
635 aa  535  1e-150  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  49.45 
 
 
642 aa  535  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  48.4 
 
 
640 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  48.41 
 
 
644 aa  534  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  46.97 
 
 
637 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  45.4 
 
 
640 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  45.29 
 
 
660 aa  533  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  46.43 
 
 
638 aa  531  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  47.93 
 
 
640 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  48.41 
 
 
640 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  47.21 
 
 
644 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  47.76 
 
 
640 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  46.55 
 
 
652 aa  526  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.68 
 
 
638 aa  528  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 
640 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  46.56 
 
 
650 aa  522  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 
640 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 
640 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 
640 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  45.79 
 
 
645 aa  524  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 
647 aa  524  1e-147  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  47.76 
 
 
640 aa  525  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  45.71 
 
 
650 aa  524  1e-147  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 
640 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 
640 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  47.69 
 
 
635 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  44.18 
 
 
637 aa  522  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  45.54 
 
 
644 aa  519  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  42.92 
 
 
675 aa  518  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  43.58 
 
 
643 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  48.57 
 
 
655 aa  521  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  45.94 
 
 
650 aa  519  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>