71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf004 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf004  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  149  1e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  39.71 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  36.36 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  42.37 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  33.33 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  35.38 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  41.27 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  31.88 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  30.43 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.41 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1990  hypothetical protein  39.34 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0003  S4-like RNA binding protein  35.42 
 
 
49 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31544e-26 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  42.86 
 
 
58 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  42.37 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.76 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  32 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  33.82 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  34.48 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  27.27 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  32.84 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  26.67 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  40.35 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  33.33 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  31.67 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  36.21 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  35.29 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  43.64 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1502  RNA-binding S4  39.34 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  41.82 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  38.6 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  41.82 
 
 
58 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  32.26 
 
 
71 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  31.08 
 
 
80 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0003  S4 domain-containing protein  37.29 
 
 
68 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1515  RNA-binding S4 domain protein  45.1 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.686645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  32.08 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  32.73 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  38 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  31.03 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  31.82 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  31.82 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.03 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  40 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  40 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2211  hypothetical protein  30.65 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0528785  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.03 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0968  hypothetical protein  30.65 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.36 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0366  hypothetical protein  27.69 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0798  hypothetical protein  29.03 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0972  hypothetical protein  30.65 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0910033  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  34.43 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  31.03 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2823  hypothetical protein  30.65 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0503  hypothetical protein  30.65 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000422283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1834  hypothetical protein  30.65 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0149554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2938  hypothetical protein  30.65 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196039  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2884  hypothetical protein  30.65 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1581  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.79 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0305147  normal  0.476483 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2771  hypothetical protein  30.65 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00316834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2510  hypothetical protein  30.65 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000911795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  30 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  31.34 
 
 
74 aa  40  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1042  hypothetical protein  27.42 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2942  hypothetical protein  27.42 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  28.57 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1092  hypothetical protein  29.03 
 
 
87 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1051  hypothetical protein  29.03 
 
 
87 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751549  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0613  hypothetical protein  29.03 
 
 
87 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4205  hypothetical protein  29.03 
 
 
72 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00355095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>