More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf001 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
454 aa  913    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.86 
 
 
456 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.05 
 
 
476 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.88 
 
 
476 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  30.18 
 
 
440 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  33.05 
 
 
477 aa  189  9e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  33.84 
 
 
463 aa  189  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
450 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
462 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.54 
 
 
462 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.24 
 
 
464 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  28.7 
 
 
459 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
462 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  33.84 
 
 
467 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0001  chromosomal replication initiation protein  30.57 
 
 
450 aa  187  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14003  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  33.83 
 
 
500 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
477 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.77 
 
 
539 aa  187  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
467 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.54 
 
 
467 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
467 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
467 aa  187  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
466 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
467 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  34.69 
 
 
492 aa  187  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
467 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
467 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
466 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
466 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
466 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  33.54 
 
 
467 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 
466 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  29.46 
 
 
489 aa  186  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 
465 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  33.61 
 
 
475 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.91 
 
 
465 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  33.52 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.62 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0001  chromosomal replication initiation protein  32.48 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.817172  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  35.44 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  31.09 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.23 
 
 
483 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.74 
 
 
474 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  34.53 
 
 
490 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.21 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  30.21 
 
 
481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  32.32 
 
 
472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  33.44 
 
 
462 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  32.32 
 
 
468 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  32.32 
 
 
468 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  35.03 
 
 
491 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  33.53 
 
 
440 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 
468 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.65 
 
 
503 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.87 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  35.03 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  26.78 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  30.03 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  26.78 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.9 
 
 
491 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.13 
 
 
462 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.86 
 
 
469 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  32.42 
 
 
533 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  31.04 
 
 
462 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.62 
 
 
467 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000009849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  31.04 
 
 
462 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  31.04 
 
 
462 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  31.04 
 
 
462 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  32.36 
 
 
477 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl001  chromosomal replication initiation protein  32.75 
 
 
443 aa  177  2e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  31.09 
 
 
454 aa  178  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.19 
 
 
442 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 
460 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  33.13 
 
 
461 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  32.44 
 
 
457 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  31.32 
 
 
461 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 
460 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 
460 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 
461 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 
460 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  32.52 
 
 
462 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.28 
 
 
474 aa  177  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.54 
 
 
452 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.24 
 
 
458 aa  176  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  28.54 
 
 
451 aa  176  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  29.49 
 
 
446 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  31.42 
 
 
443 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.36 
 
 
475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.27 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  31.27 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  31.89 
 
 
507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  32.21 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  29.84 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  28.8 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.1 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  31.89 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  30.48 
 
 
524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  31.58 
 
 
505 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  26.5 
 
 
451 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>