53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R27 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_R27  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.469353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.71 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.71 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  85.71 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  85.33 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  85.33 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  85.33 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  85.33 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  85.33 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  85.33 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  85.33 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  85.33 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  85.14 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  85.14 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0053  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0069  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0196822  normal  0.911508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>