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for query gene MADE_04022 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  100 
 
 		 416 aa  832    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.46 
 
 		 410 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.65 
 
 		 422 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.13 
 
 		 414 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.6 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.39 
 
 		 405 aa  296  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  39.9 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.89 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.58 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.79 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  34.74 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.41 
 
 		 421 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.84 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 421 aa  236  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  36.93 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.31 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.93 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.18 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.18 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.73 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.58 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.59 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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NC_011989  Avi_1935  MFS permease  35.73 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 405 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.18 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  35.75 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.55 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.99 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.85 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
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NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.85 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.63 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 397 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.23 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.14 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.27 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.22 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.11 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.07 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.01 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  28.23 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.41 
 
 		 406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.18 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.61 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.88 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.44 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.59 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.82 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.26 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.46 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.8 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.94 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.6 
 
 		 424 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.29 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.97 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.9 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.9 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.21 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.48 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  27.99 
 
 		 426 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.64 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.03 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.76 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  25.87 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.79 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.26 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.72 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.27 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.99 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.26 
 
 		 398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.56 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.56 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  29.05 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.32 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.39 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.79 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.25 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.11 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.26 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.54 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31 
 
 		 402 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.08 
 
 		 417 aa  126  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.86 
 
 		 405 aa  126  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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