More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04004 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  100 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  53.55 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  42.34 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  42.18 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  42.53 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  44.83 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  42.2 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  41.86 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  41.86 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  45.03 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  40.19 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  51.68 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  40.93 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  43.1 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  38.6 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  42.01 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  49.65 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  38.95 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  42.21 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  35.95 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  36.42 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  34.95 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  36.9 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  34.41 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  35.75 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  41.43 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 210 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  39.58 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 210 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  38.89 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  35.93 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  41.72 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.57 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 197 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  29.33 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  32.93 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  32.32 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  35.86 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  35.82 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  31.33 
 
 		 286 aa  98.2  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  35.14 
 
 		 197 aa  97.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  31.82 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  34.07 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  31.33 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  30.9 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  30.9 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 203 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  35.56 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  29.55 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  33.6 
 
 		 185 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  32.48 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  33.56 
 
 		 287 aa  91.7  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  31.38 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  31.38 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  31.38 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  33.55 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  31.38 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  31.38 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  34.21 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  34.21 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  29.28 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>