174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03975 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
543 aa  1124    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  47.84 
 
 
546 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  42.08 
 
 
522 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  41.43 
 
 
588 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  42.11 
 
 
498 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  42.57 
 
 
514 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  41.96 
 
 
504 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  42.29 
 
 
525 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  42.15 
 
 
530 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  41.94 
 
 
520 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  41.65 
 
 
533 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  40.2 
 
 
534 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  39.41 
 
 
503 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  40.83 
 
 
519 aa  350  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  38.73 
 
 
540 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  39.22 
 
 
542 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  39.18 
 
 
532 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  39.83 
 
 
559 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 
545 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  37.31 
 
 
608 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  37.31 
 
 
562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  37.31 
 
 
562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  37.31 
 
 
562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  39.2 
 
 
544 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  36.31 
 
 
594 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  39.83 
 
 
528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  37.19 
 
 
597 aa  337  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.91 
 
 
545 aa  336  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
533 aa  336  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  36.16 
 
 
604 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
517 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
517 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
517 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
517 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  38.49 
 
 
545 aa  334  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  35.98 
 
 
604 aa  334  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  38.49 
 
 
545 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  35.98 
 
 
558 aa  333  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  38.49 
 
 
498 aa  333  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  40 
 
 
517 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
511 aa  332  8e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
511 aa  332  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
511 aa  332  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
511 aa  332  8e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  40.04 
 
 
511 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  40.04 
 
 
511 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  40.04 
 
 
517 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
517 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
517 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  37.7 
 
 
495 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  38.75 
 
 
519 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  39.96 
 
 
528 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  39.96 
 
 
511 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  38.12 
 
 
568 aa  329  7e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  37.24 
 
 
542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  37.24 
 
 
542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  39.92 
 
 
540 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  35.19 
 
 
503 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  37.03 
 
 
542 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  37.03 
 
 
542 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  38.66 
 
 
525 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  40.13 
 
 
508 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  38.59 
 
 
530 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  39.28 
 
 
522 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  38.25 
 
 
534 aa  325  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  36.17 
 
 
579 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  37.97 
 
 
540 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 
522 aa  324  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  37.97 
 
 
540 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  38.46 
 
 
525 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  37.47 
 
 
522 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
522 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  36.53 
 
 
529 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  38.76 
 
 
522 aa  320  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  36.02 
 
 
579 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  36.65 
 
 
641 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  38.83 
 
 
522 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  36.97 
 
 
551 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  38.52 
 
 
517 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  37.4 
 
 
534 aa  317  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  35.55 
 
 
543 aa  317  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  37.81 
 
 
540 aa  316  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  34.6 
 
 
519 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  35.9 
 
 
537 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  35.9 
 
 
537 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  37.87 
 
 
559 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  37.25 
 
 
505 aa  313  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  35.86 
 
 
642 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  38.05 
 
 
530 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  38.32 
 
 
511 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  37.02 
 
 
541 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  37.35 
 
 
532 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  37.06 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  34.1 
 
 
529 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  37.4 
 
 
527 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  35.61 
 
 
534 aa  310  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  35.15 
 
 
604 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  35.15 
 
 
529 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  35.15 
 
 
529 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  37.45 
 
 
559 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>