153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03932 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  52 
 
 		 202 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3930  hypothetical protein  52.38 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  50.75 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1056  hypothetical protein  45.71 
 
 		 217 aa  192  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  47.15 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07816  hypothetical protein  36.63 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0518  hypothetical protein  41.43 
 
 		 152 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  30.46 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  28.31 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  27.03 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  27.69 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  27.78 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.33 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  27.5 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  27.22 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  24.21 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  25.15 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  34.65 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  25.4 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  27.04 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  27.27 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  27.22 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  27.27 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  26.79 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  33.66 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  25.26 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  34.65 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.66 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  28.4 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  24.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  27.32 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  27.32 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.49 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  29.53 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  27.54 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  28.4 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.95 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  33.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  33.66 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  25.53 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  31.01 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  28.65 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.56 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  28.4 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  24.61 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  24.61 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.59 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  25.15 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  25.32 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  24.08 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  27.1 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.58 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  27.1 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  26.11 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  29.51 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  28.68 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.09 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  29.38 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  25 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  29.32 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  30.51 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.35 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  28.47 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  25.52 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.56 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  32.67 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  24.43 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  32.67 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  27.7 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  26.04 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  32.14 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  26.09 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  25.15 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  28.15 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  29.61 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  24.48 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  27.68 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  27.5 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  25.45 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  25.64 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  22.56 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.61 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  25.48 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  26.89 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.77 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.14 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  29.1 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>