More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03887 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03887  YvaA  100 
 
 		 346 aa  713    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  46.36 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  46.15 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.25 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  43.95 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.02 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.82 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.82 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.82 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  42.73 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  43.82 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  43.66 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  43.02 
 
 		 343 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  41.52 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.27 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  44.51 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  39.47 
 
 		 346 aa  265  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.69 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  40.71 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  40.6 
 
 		 346 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  40.3 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  40.3 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  40.3 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  39.94 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  40 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  39.88 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  40.12 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  40.12 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  40.06 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  40.12 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  40.41 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  39.64 
 
 		 346 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  40.3 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  40.53 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.12 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  40.3 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  40.3 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  40.3 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  40.3 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  42.12 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  40.24 
 
 		 348 aa  248  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  40.3 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  40 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  40 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  39.42 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  37.76 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.12 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.12 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.12 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.12 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  42.12 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  48.87 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  43.11 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  37.5 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  37.32 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  42.23 
 
 		 350 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  42.23 
 
 		 350 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  41.35 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  41.69 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  40.88 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  42.35 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  38.55 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  37.21 
 
 		 350 aa  232  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  40.88 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  39.16 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  36.71 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  38.21 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  42.23 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  39.4 
 
 		 358 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  39.4 
 
 		 358 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  35.47 
 
 		 348 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0147  oxidoreductase domain-containing protein  41.18 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  35.54 
 
 		 336 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  35.9 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  37.24 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  39.31 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  41.42 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  36.92 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  37.65 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  34.6 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  34.82 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  34.59 
 
 		 362 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  35.33 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  35.33 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  35.33 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  35.33 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  35.33 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  31.81 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  35.03 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  35.54 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  35.03 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  32.7 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>