More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03799 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  100 
 
 		 524 aa  1054    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  41.94 
 
 		 529 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  43.03 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2649  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit 2  43.42 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123588  normal  0.0278702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1031  putative metabolite transport protein CsbC  58.43 
 
 		 251 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  32.95 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  30.33 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  32.94 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  31.91 
 
 		 499 aa  253  7e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  32.23 
 
 		 445 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  39.05 
 
 		 448 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  31.29 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  31.58 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  32.82 
 
 		 474 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  33.47 
 
 		 480 aa  243  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  31.82 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  33.86 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  31.78 
 
 		 468 aa  236  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  31.53 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  32.15 
 
 		 487 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  40.55 
 
 		 466 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  31.4 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  31.95 
 
 		 474 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  30.02 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  32.12 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  33.53 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  31.54 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  30.43 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  30.5 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  31.5 
 
 		 437 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.28 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  36.8 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  35.52 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  29.33 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  38.97 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  30.28 
 
 		 475 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  33.2 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  32.02 
 
 		 470 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  37.92 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  30.3 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  35.6 
 
 		 491 aa  216  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  35.6 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  35.6 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  33 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  33 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  35.6 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  35.6 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  35.6 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  33 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  31.62 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  35.33 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  31.76 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  33.92 
 
 		 475 aa  213  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  37.69 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  33.63 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  30.71 
 
 		 544 aa  210  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  38.26 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.9 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1032  putative transmembrane sugar transporter  50.93 
 
 		 225 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  30.84 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  29.13 
 
 		 497 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  37.07 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  34.68 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  32.55 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  34.93 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  34.12 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  33.73 
 
 		 485 aa  207  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  29.02 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  35.29 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  34.83 
 
 		 467 aa  203  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  30.74 
 
 		 479 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  29.48 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  30.5 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  30.31 
 
 		 475 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  28.82 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  35.31 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  39.75 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  37.97 
 
 		 465 aa  197  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  38.26 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  38.26 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  38.26 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  38.26 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  38.26 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  36.97 
 
 		 482 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  30.94 
 
 		 479 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  37.13 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  36.71 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  36.42 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  36.42 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  36.42 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  36.42 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  37.39 
 
 		 464 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  36.42 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  36.42 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  28.28 
 
 		 655 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  36.42 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  36.42 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  37.39 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  37.39 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  37.39 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>