217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03672 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  100 
 
 		 409 aa  842    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  61.27 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  50.54 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  50.38 
 
 		 405 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  47.63 
 
 		 413 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  42.03 
 
 		 392 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  41.44 
 
 		 402 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  41.3 
 
 		 444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  32.51 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  33.75 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  31.2 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  33.25 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  31.66 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.09 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  29.24 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  31.87 
 
 		 399 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  28.5 
 
 		 602 aa  175  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  30.35 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  30.88 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  30.15 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  30.49 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  32.18 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.45 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  28.4 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  29.38 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.06 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  27.36 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  29.62 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  28.84 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  32.74 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.57 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  28.41 
 
 		 448 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  28.64 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  26.89 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  29.47 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  28.65 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.18 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  27.46 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  26.41 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  29.61 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  24.13 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  28.07 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  24.87 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  27.03 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  23.97 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  26.08 
 
 		 307 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  27.06 
 
 		 315 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.98 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  24.21 
 
 		 397 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  25.98 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  24.2 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  25.27 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  25.49 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  24.25 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  24.18 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  26.32 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.32 
 
 		 355 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  23.85 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  26.22 
 
 		 326 aa  106  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  26.13 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  25.78 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  24.05 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  23.53 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  26.46 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  26.85 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  27.03 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  28.72 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  25.5 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  28.47 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  22.94 
 
 		 355 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  27.71 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  23.3 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  26.67 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  25.07 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  23.27 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  23.58 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  30.7 
 
 		 307 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  25 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  29.72 
 
 		 329 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  25.89 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  25 
 
 		 352 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  24 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  21.1 
 
 		 320 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  27.8 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  23.17 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  26.19 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  26.19 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0282  peptidase M19, renal dipeptidase  21.7 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00197146  normal  0.781669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4792  periplasmic dipeptidase  43.56 
 
 		 102 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.31108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  23.88 
 
 		 393 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  26.59 
 
 		 327 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  22.12 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.25 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  25.84 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  21.86 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  27.52 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  22.02 
 
 		 325 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  24.38 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>