54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03602 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  528  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  48.89 
 
 
313 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  45.83 
 
 
375 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  40.4 
 
 
277 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  45.04 
 
 
345 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  39.27 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  44.96 
 
 
180 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  52.38 
 
 
295 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  43.88 
 
 
259 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  41.86 
 
 
314 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  38.67 
 
 
315 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  41.22 
 
 
252 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  40.74 
 
 
304 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  40.74 
 
 
304 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  40.77 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  40.32 
 
 
311 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  37.01 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  36.36 
 
 
328 aa  95.1  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  37.5 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  37.41 
 
 
323 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  37.32 
 
 
323 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  33.1 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  39.37 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  34.65 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  38.17 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  42.17 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  35.07 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  33.06 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  35.29 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  30.26 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  34.59 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  29.61 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  35.51 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  40.24 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  30.23 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  30.61 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30.07 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  42.25 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  28.47 
 
 
304 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
424 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  32.18 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  33.72 
 
 
303 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  32.04 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  28.95 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  34.72 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  45.24 
 
 
59 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  38.16 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  29.84 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  31.62 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  31.4 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  32.77 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  32.77 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5550  hypothetical protein  26.32 
 
 
454 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.463025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  35.8 
 
 
462 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>