More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03481 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  100 
 
 
908 aa  1880    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  30.94 
 
 
884 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1002 aa  364  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
1013 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
1002 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
1002 aa  333  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
746 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
745 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
746 aa  310  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.65 
 
 
745 aa  307  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  29.02 
 
 
745 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  28.37 
 
 
1003 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
762 aa  292  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  29.85 
 
 
993 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  26.73 
 
 
755 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
758 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
748 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
758 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 
756 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
748 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  27.7 
 
 
762 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  27.17 
 
 
776 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
751 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
749 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
775 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1419 aa  267  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
1965 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
779 aa  265  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
769 aa  265  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
751 aa  264  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
751 aa  263  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 
1431 aa  263  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
752 aa  262  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 
1501 aa  261  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
708 aa  258  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
775 aa  257  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1297 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
762 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 
1184 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  38.02 
 
 
1399 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
799 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
760 aa  251  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
760 aa  251  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
628 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  27.69 
 
 
728 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
743 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
791 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
1287 aa  248  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 
955 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
1478 aa  247  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
720 aa  247  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
865 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  27.27 
 
 
728 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
696 aa  244  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1330 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
934 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
769 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  30.67 
 
 
856 aa  241  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
889 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
1557 aa  241  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  38.32 
 
 
678 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
882 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  25.97 
 
 
855 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.72 
 
 
1407 aa  237  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
774 aa  237  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  37.16 
 
 
459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
697 aa  235  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
760 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1002 aa  234  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
765 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
1068 aa  234  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
757 aa  233  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09008  PhytochromePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5K039]  26.71 
 
 
1280 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  37.47 
 
 
725 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
1391 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  36.04 
 
 
1131 aa  231  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
1548 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
519 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
662 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
701 aa  227  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  30.27 
 
 
856 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1331 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  29.42 
 
 
842 aa  223  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1808 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  25.75 
 
 
759 aa  220  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
771 aa  219  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27 
 
 
849 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
680 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
587 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
755 aa  217  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.95 
 
 
1214 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
947 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
796 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
653 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  30.46 
 
 
722 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
783 aa  212  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
606 aa  211  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
768 aa  211  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.9 
 
 
846 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
656 aa  210  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>