More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03448 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
266 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  74.06 
 
 
266 aa  363  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.51 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.38 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.77 
 
 
266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60 
 
 
266 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.62 
 
 
266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.62 
 
 
266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.62 
 
 
266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.62 
 
 
266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.25 
 
 
266 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.25 
 
 
266 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.87 
 
 
266 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.65 
 
 
266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.25 
 
 
266 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.04 
 
 
272 aa  301  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.08 
 
 
266 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.23 
 
 
266 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.74 
 
 
266 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.62 
 
 
265 aa  295  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  56.11 
 
 
267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  55.34 
 
 
266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.92 
 
 
267 aa  276  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  56.03 
 
 
267 aa  275  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.42 
 
 
267 aa  274  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.64 
 
 
267 aa  268  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.34 
 
 
265 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.55 
 
 
265 aa  264  8.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.85 
 
 
266 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.91 
 
 
264 aa  250  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.81 
 
 
264 aa  241  6e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.23 
 
 
265 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2096  undecaprenyl-diphosphatase  48.46 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.76838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  44.81 
 
 
265 aa  208  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.6 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  43.07 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  39.16 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  41.06 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  43.75 
 
 
270 aa  195  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  39.1 
 
 
386 aa  194  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  38.71 
 
 
289 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  45.76 
 
 
269 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  38.38 
 
 
277 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.45 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  38.78 
 
 
285 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  42.91 
 
 
261 aa  188  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  41.15 
 
 
272 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  41.79 
 
 
268 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  40.47 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.43 
 
 
292 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  39.16 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  39.38 
 
 
272 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  40.53 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
277 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  39.85 
 
 
264 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  39.92 
 
 
272 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  40.86 
 
 
274 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.36 
 
 
276 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  42.32 
 
 
271 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.96 
 
 
267 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  42.37 
 
 
273 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  42.7 
 
 
271 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.16 
 
 
267 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.48 
 
 
282 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  39.08 
 
 
281 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  39.26 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  38.49 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.63 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.92 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.51 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  38.58 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.92 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.97 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.4 
 
 
276 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  40.08 
 
 
302 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.43 
 
 
282 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.91 
 
 
286 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  38.15 
 
 
290 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  40.31 
 
 
279 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  40.31 
 
 
262 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  41.24 
 
 
304 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  39.84 
 
 
281 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.47 
 
 
280 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.05 
 
 
282 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.27 
 
 
278 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.98 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.33 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.24 
 
 
283 aa  166  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  43.63 
 
 
272 aa  165  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.64 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.35 
 
 
280 aa  165  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.82 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.47 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.6 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  36.92 
 
 
278 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.02 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1174  bacitracin resistance protein BacA  37.87 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>