More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03364 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  100 
 
 
422 aa  862    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  36.58 
 
 
359 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
359 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  31.27 
 
 
380 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
359 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  34.77 
 
 
359 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
359 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.3 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
363 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
367 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.81 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  31.25 
 
 
386 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  27.38 
 
 
376 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  27.38 
 
 
376 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  26.82 
 
 
376 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  26.53 
 
 
376 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  26.53 
 
 
376 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  27.21 
 
 
376 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  28.14 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
393 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
376 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  29.21 
 
 
364 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  25.07 
 
 
361 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  30.19 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  26.39 
 
 
386 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  29.19 
 
 
376 aa  96.7  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  31.38 
 
 
423 aa  93.6  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  30.89 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  29.89 
 
 
363 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
399 aa  90.1  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
404 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  28.12 
 
 
383 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
363 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  27.17 
 
 
363 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  31.4 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  29.17 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  31.93 
 
 
611 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  29.3 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  25.75 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  25.86 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.6 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  25 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  24.64 
 
 
399 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  27.92 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  29.65 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  26.72 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  27.94 
 
 
380 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.37 
 
 
726 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.88 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  26.77 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.48 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.91 
 
 
699 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.67 
 
 
581 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  27.93 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.31 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  26.03 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  26.4 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
688 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.76 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  25.44 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  26.83 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  25.08 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1657  histidine kinase  25.7 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.174163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  25.52 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  25.7 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
742 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1607  sensor histidine kinase  25.7 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  30.89 
 
 
489 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.13 
 
 
458 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  23.39 
 
 
786 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1638  sensor histidine kinase  25.7 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000803844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>