More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03328 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.02 
 
 
822 aa  894    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  54.05 
 
 
820 aa  843    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  54.05 
 
 
820 aa  843    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.87 
 
 
819 aa  868    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.05 
 
 
820 aa  843    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.38 
 
 
819 aa  900    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.84 
 
 
821 aa  896    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.32 
 
 
818 aa  871    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.05 
 
 
820 aa  843    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4291  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.51 
 
 
825 aa  848    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.43 
 
 
819 aa  875    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  57.21 
 
 
821 aa  912    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.87 
 
 
822 aa  891    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  54.05 
 
 
820 aa  843    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.61 
 
 
819 aa  863    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.61 
 
 
819 aa  863    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  53.92 
 
 
820 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.58 
 
 
821 aa  894    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  53.8 
 
 
820 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.19 
 
 
818 aa  867    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.69 
 
 
825 aa  905    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  53.8 
 
 
820 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.92 
 
 
820 aa  833    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  74.41 
 
 
820 aa  1205    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1214  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.06 
 
 
816 aa  798    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.05 
 
 
820 aa  843    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.14 
 
 
822 aa  891    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.02 
 
 
822 aa  890    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.05 
 
 
818 aa  842    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  57.34 
 
 
821 aa  918    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.31 
 
 
819 aa  873    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.61 
 
 
819 aa  864    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.14 
 
 
822 aa  897    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.62 
 
 
819 aa  892    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.65 
 
 
822 aa  889    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  56.38 
 
 
819 aa  897    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  100 
 
 
804 aa  1654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.03 
 
 
821 aa  855    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.7 
 
 
820 aa  872    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.27 
 
 
822 aa  897    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  53.92 
 
 
820 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.05 
 
 
820 aa  843    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  53.92 
 
 
820 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.39 
 
 
822 aa  899    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.39 
 
 
822 aa  899    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.38 
 
 
819 aa  887    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.64 
 
 
822 aa  904    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  53.92 
 
 
820 aa  842    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.62 
 
 
817 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  38.86 
 
 
823 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.46 
 
 
835 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.13 
 
 
835 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.52 
 
 
815 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.8 
 
 
835 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.85 
 
 
819 aa  528  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  36.85 
 
 
818 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.8 
 
 
823 aa  524  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.72 
 
 
819 aa  525  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.93 
 
 
820 aa  525  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16870  predicted protein  38.77 
 
 
810 aa  519  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254094  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.1 
 
 
819 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.92 
 
 
822 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.92 
 
 
815 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.85 
 
 
815 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.26 
 
 
834 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 
814 aa  493  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.01 
 
 
818 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  36.13 
 
 
815 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0411  aspartate kinase  34.85 
 
 
804 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.204569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  34.29 
 
 
804 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22113  bifunctional aspartokinase  30.93 
 
 
870 aa  355  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4075  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.81 
 
 
810 aa  349  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4480  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.81 
 
 
810 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.27821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4045  aspartate kinase  32.81 
 
 
810 aa  348  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4174  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.81 
 
 
810 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4426  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.81 
 
 
810 aa  348  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5400  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.81 
 
 
810 aa  348  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.324557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4382  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.67 
 
 
810 aa  347  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.810334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03826  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.67 
 
 
810 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.087529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03775  hypothetical protein  32.67 
 
 
810 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0902999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0122  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.76 
 
 
811 aa  343  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0617  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.65 
 
 
797 aa  342  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3806  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.76 
 
 
811 aa  343  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4094  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.76 
 
 
811 aa  343  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0190  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.34 
 
 
811 aa  342  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4432  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.39 
 
 
810 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4435  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.05 
 
 
810 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.941973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4318  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.39 
 
 
810 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4502  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.39 
 
 
810 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4348  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.39 
 
 
810 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3790  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.16 
 
 
811 aa  340  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.395473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4034  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.33 
 
 
810 aa  340  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.522954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0121  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.94 
 
 
811 aa  339  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4785  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  33.05 
 
 
811 aa  337  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0537  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.63 
 
 
797 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0178  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.2 
 
 
811 aa  335  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0565  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.75 
 
 
797 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0561  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.5 
 
 
797 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3775  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.53 
 
 
797 aa  334  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0561  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.04 
 
 
797 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>