258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03312 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  100 
 
 
240 aa  478  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  59.57 
 
 
240 aa  289  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  39.18 
 
 
246 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  35.53 
 
 
257 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  36.84 
 
 
257 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  39.46 
 
 
230 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  35.53 
 
 
257 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  37.97 
 
 
243 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  39.46 
 
 
230 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  39.46 
 
 
245 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  39.46 
 
 
245 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  39.46 
 
 
245 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  39.46 
 
 
245 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  39.46 
 
 
245 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  39.46 
 
 
245 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  39.46 
 
 
245 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  36.84 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  36.04 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  38.8 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  30.77 
 
 
229 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  34.54 
 
 
240 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  34.44 
 
 
242 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  31.66 
 
 
241 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  33.89 
 
 
241 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  31.66 
 
 
241 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  31.66 
 
 
241 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  33.89 
 
 
241 aa  101  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  31.66 
 
 
241 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  33.89 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.66 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.97 
 
 
233 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.34 
 
 
282 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  40.54 
 
 
242 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  33.33 
 
 
241 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  34.78 
 
 
238 aa  99  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  34.12 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4228  hypothetical protein  32.95 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.988743 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  31.58 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  32.74 
 
 
235 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  30.09 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  31.72 
 
 
246 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  30.66 
 
 
238 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.86 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.64 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  30.66 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  29.44 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  29.26 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  32.16 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  27.78 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  33.33 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  35.26 
 
 
319 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  32.09 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  32.37 
 
 
230 aa  89  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  31.11 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  32.64 
 
 
307 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  28.33 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  31.12 
 
 
234 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1853  AzlC family protein  33.71 
 
 
224 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  29.95 
 
 
231 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  29.95 
 
 
231 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  32.9 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  29.79 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  31.15 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  32.2 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  31.18 
 
 
236 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  29.19 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  29.69 
 
 
242 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  30.85 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  31.76 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  30.73 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  35.93 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.65 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  29.78 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.53 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  27.39 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  30.85 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.27 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  28.45 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  29.07 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  28.77 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  27.43 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  30.04 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  29.54 
 
 
285 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  30.4 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  31.5 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  29.24 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  31.79 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  35.97 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  28.21 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  29.22 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06980  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.9 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000303434  normal  0.415503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  25.68 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  27.23 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  28.76 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.79 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  36.02 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  30.84 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0790  AzlC family protein  37.24 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.31 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  31.63 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>