More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03249 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  100 
 
 
127 aa  259  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  59.84 
 
 
130 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  60.48 
 
 
317 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  55.47 
 
 
129 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  56.8 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  56.8 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  56 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  56 
 
 
132 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  56 
 
 
130 aa  140  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  55.2 
 
 
134 aa  140  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  53.23 
 
 
131 aa  140  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  53.91 
 
 
129 aa  140  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  57.6 
 
 
314 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  54.4 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  55.12 
 
 
129 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  54.4 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  57.48 
 
 
329 aa  135  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  56.8 
 
 
314 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  54.74 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  57.6 
 
 
316 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  53.6 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  52.8 
 
 
128 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  56 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  56 
 
 
314 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  56 
 
 
314 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  54.4 
 
 
315 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  51.59 
 
 
319 aa  130  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  56 
 
 
314 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  55.2 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  49.61 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  56.52 
 
 
317 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  50.4 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  55.2 
 
 
313 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  53.6 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  53.6 
 
 
315 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  48.03 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  57.14 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  48.8 
 
 
314 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  48.39 
 
 
132 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  48.44 
 
 
134 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  48.41 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  45.24 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.24 
 
 
132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  50 
 
 
306 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  45.67 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  45.67 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.66 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.62 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.67 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.66 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.62 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  46.77 
 
 
321 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.66 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.62 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  49.19 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.88 
 
 
131 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.88 
 
 
131 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  45.53 
 
 
316 aa  110  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.88 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.88 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.88 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.88 
 
 
131 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  44.88 
 
 
129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  44.88 
 
 
129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.88 
 
 
129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  44.88 
 
 
129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  44.8 
 
 
322 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.09 
 
 
129 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.09 
 
 
129 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  40.91 
 
 
315 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  41.27 
 
 
352 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  42.4 
 
 
386 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  41.27 
 
 
310 aa  94.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  45.3 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  45.3 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40.16 
 
 
318 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  40.48 
 
 
352 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  94  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  43.24 
 
 
363 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
360 aa  92  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  40 
 
 
329 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  40 
 
 
329 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  38.58 
 
 
130 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  41.73 
 
 
142 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  41.73 
 
 
141 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  42.4 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
360 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
129 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.3 
 
 
347 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  40 
 
 
302 aa  88.6  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  38.4 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
147 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  40.8 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  40.8 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.72 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>