196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03135 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  37.27 
 
 		 1265 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  37.71 
 
 		 1232 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  39.6 
 
 		 1226 aa  734    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1238 aa  2509    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  38.24 
 
 		 1227 aa  635  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  37.34 
 
 		 1227 aa  625  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  36.63 
 
 		 1137 aa  609  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  35.83 
 
 		 1227 aa  572  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  33.72 
 
 		 1247 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  30.14 
 
 		 1088 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  30.28 
 
 		 1223 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.94 
 
 		 1219 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  28.42 
 
 		 1226 aa  423  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  29.84 
 
 		 1227 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  29.13 
 
 		 1223 aa  382  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  29.33 
 
 		 1244 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  50.14 
 
 		 1232 aa  348  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  50.39 
 
 		 1083 aa  318  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  54.52 
 
 		 1046 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  54.52 
 
 		 1046 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  54.52 
 
 		 1046 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  54.52 
 
 		 1046 aa  315  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  53.72 
 
 		 1046 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  50.41 
 
 		 1048 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  55.7 
 
 		 1047 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  51.16 
 
 		 1047 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  55.7 
 
 		 1047 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  55.7 
 
 		 1047 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  55.7 
 
 		 1048 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  55.7 
 
 		 1048 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  36.19 
 
 		 1229 aa  310  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  36.05 
 
 		 1229 aa  308  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  55.37 
 
 		 1047 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  36.19 
 
 		 1220 aa  307  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  54.72 
 
 		 1047 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  53.97 
 
 		 1042 aa  297  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  34.9 
 
 		 1227 aa  295  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  61.71 
 
 		 1164 aa  287  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  37.14 
 
 		 1155 aa  279  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  33.93 
 
 		 1234 aa  271  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  55.23 
 
 		 1144 aa  271  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  54.39 
 
 		 1308 aa  263  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  28.06 
 
 		 1230 aa  251  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  35.46 
 
 		 1165 aa  244  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  49.38 
 
 		 1303 aa  243  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  50.47 
 
 		 1091 aa  239  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  47.01 
 
 		 1346 aa  238  8e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  50.47 
 
 		 1091 aa  236  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  48.18 
 
 		 1307 aa  235  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  29.25 
 
 		 1213 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  29.79 
 
 		 1085 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  43.72 
 
 		 1224 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  44.6 
 
 		 1211 aa  197  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  52.11 
 
 		 1211 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  47.71 
 
 		 1214 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  51.85 
 
 		 1214 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  56.25 
 
 		 1214 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  56.25 
 
 		 1214 aa  175  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  49.74 
 
 		 1214 aa  175  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  56.25 
 
 		 1214 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  35.25 
 
 		 1182 aa  169  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  31.61 
 
 		 1248 aa  164  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  39.54 
 
 		 1101 aa  163  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  36.29 
 
 		 1248 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  54.55 
 
 		 1248 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  46.03 
 
 		 1280 aa  139  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  35.78 
 
 		 1245 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  35.78 
 
 		 1247 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  43.5 
 
 		 1291 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  34.29 
 
 		 1018 aa  129  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  35.78 
 
 		 1245 aa  128  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  47.95 
 
 		 1009 aa  127  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  45.64 
 
 		 1029 aa  125  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  36.72 
 
 		 953 aa  125  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.52 
 
 		 1020 aa  125  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  47.26 
 
 		 962 aa  124  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  44.97 
 
 		 1029 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  44.97 
 
 		 1029 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  44.97 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  44.97 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  44.97 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  44.97 
 
 		 1029 aa  124  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  44.97 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  44.97 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  33.13 
 
 		 1018 aa  122  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  32.79 
 
 		 1013 aa  122  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  34.8 
 
 		 1018 aa  122  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  44.3 
 
 		 1029 aa  121  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  44.3 
 
 		 1029 aa  121  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  33.22 
 
 		 1018 aa  121  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  37.73 
 
 		 1018 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  49.61 
 
 		 1025 aa  120  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  44.44 
 
 		 995 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.78 
 
 		 881 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  33.89 
 
 		 1018 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  45.75 
 
 		 986 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  37.14 
 
 		 906 aa  119  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  33.95 
 
 		 1018 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  34.85 
 
 		 1018 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  34.85 
 
 		 1018 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>