34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03118 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  100 
 
 		 308 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  45.05 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  42.02 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  35.12 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  38 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  32.27 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  35.68 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  30.88 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  32.62 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  31.9 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  29.21 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  30.51 
 
 		 188 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  26.42 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  26.39 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  30.52 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  28 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  25.13 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  25.13 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  29.86 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  26.92 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  28.57 
 
 		 164 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  26.32 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  23.53 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  27.78 
 
 		 1717 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0069  TPR repeat-containing protein  20.31 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 433 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0582  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  29.84 
 
 		 748 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>