107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03077 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  100 
 
 
398 aa  801  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  64.07 
 
 
397 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  41.28 
 
 
408 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  32.27 
 
 
409 aa  223  5e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  29.95 
 
 
403 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  27.39 
 
 
392 aa  141  2e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  33.06 
 
 
830 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 
405 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  26.65 
 
 
394 aa  132  1e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
394 aa  128  2e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
388 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  24.89 
 
 
775 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 
405 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
413 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  24.76 
 
 
395 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  23.25 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  27.4 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  24.34 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 
378 aa  85.9  1e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  25.38 
 
 
394 aa  84.3  3e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  26.08 
 
 
390 aa  84.7  3e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  24.56 
 
 
397 aa  84  4e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  25.38 
 
 
394 aa  83.6  6e-15  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 
381 aa  81.6  2e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
415 aa  80.1  7e-14  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  25 
 
 
382 aa  79.3  1e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  25 
 
 
379 aa  77.8  3e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  25.06 
 
 
387 aa  77  5e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  26.65 
 
 
378 aa  76.3  8e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  24.76 
 
 
379 aa  75.1  2e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  24.76 
 
 
379 aa  74.3  3e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  24.03 
 
 
379 aa  72.4  1e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
377 aa  72.8  1e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  24.82 
 
 
379 aa  71.6  2e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  24.57 
 
 
379 aa  71.6  2e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  24.46 
 
 
378 aa  71.2  3e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  24.27 
 
 
379 aa  70.9  4e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  24.27 
 
 
379 aa  70.9  4e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  24.27 
 
 
379 aa  70.5  5e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.31098e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 
378 aa  65.1  2e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  23.2 
 
 
374 aa  59.7  8e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
193 aa  58.9  2e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  22.86 
 
 
356 aa  57.4  5e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
381 aa  57  5e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  25.98 
 
 
413 aa  56.6  8e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 
378 aa  55.8  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
368 aa  54.3  3e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
375 aa  53.9  5e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 
377 aa  53.1  7e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 
366 aa  51.6  2e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 
368 aa  52  2e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  25.32 
 
 
369 aa  51.2  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.84 
 
 
366 aa  51.6  3e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 
369 aa  51.2  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  22.81 
 
 
378 aa  50.8  4e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 
375 aa  50.8  4e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 
353 aa  50.4  5e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 
384 aa  50.1  7e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 
376 aa  49.7  8e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
384 aa  49.7  9e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  22.59 
 
 
375 aa  49.7  9e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
360 aa  49.7  9e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.77 
 
 
376 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  25.09 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  23.32 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  23.85 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 
368 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 
370 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 
412 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.21 
 
 
347 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 
368 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  21.61 
 
 
368 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  24.7 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  21.78 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.89 
 
 
906 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  24.46 
 
 
906 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  24.44 
 
 
157 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  21.46 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  23.4 
 
 
920 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  22.35 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 
360 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  21.79 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  23.85 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  23.41 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  21.63 
 
 
371 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  22.14 
 
 
388 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  24.89 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>