222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03054 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  100 
 
 
295 aa  611  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  57.2 
 
 
258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  33.46 
 
 
273 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
273 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
282 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
280 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
283 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
347 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
361 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 
377 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
341 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
269 aa  89  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  31.07 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
633 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
663 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
274 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
363 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
1250 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
353 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  28.14 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01491  hypothetical protein  26.79 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.16 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
727 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  25.82 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  25.82 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  26.82 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  22.06 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.69 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.27 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
373 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
364 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2728  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  25.24 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 
339 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
255 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
349 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
655 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.65 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
364 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.65 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  23.65 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
1177 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1177 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  22.66 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  23.85 
 
 
783 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  23.65 
 
 
249 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
334 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
581 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
1275 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.93 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.82 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>