184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03008 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
291 aa  611  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  32.23 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  32.13 
 
 
285 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  33.6 
 
 
284 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  31.05 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  31.67 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  34.51 
 
 
286 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  32.27 
 
 
285 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  30.89 
 
 
267 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  29.66 
 
 
298 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  33.17 
 
 
300 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  35.68 
 
 
284 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  32.61 
 
 
283 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  32.95 
 
 
284 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  30.84 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  33.18 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  32.88 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  32 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  33.19 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  32 
 
 
283 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  32.35 
 
 
311 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  32.58 
 
 
320 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  30.61 
 
 
292 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  31.56 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  31.88 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  32.39 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  32.31 
 
 
297 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  31.76 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  29.63 
 
 
339 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  29.81 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  31.06 
 
 
335 aa  112  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  30.36 
 
 
284 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  30.07 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  27.31 
 
 
306 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  32.66 
 
 
311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  31.73 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  27.35 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  28.03 
 
 
285 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  32.21 
 
 
305 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  30.7 
 
 
306 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  29.44 
 
 
288 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  28.57 
 
 
288 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  30.8 
 
 
335 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  27.59 
 
 
288 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  27.51 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  26.17 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  27.97 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  32.04 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  28.57 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  29.82 
 
 
276 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  28.02 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  28.02 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  28.7 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  28.02 
 
 
287 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  27.07 
 
 
276 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  28.14 
 
 
276 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  24.3 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  27.78 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  27.85 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  28.87 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  27.31 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  28.26 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  28.38 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  28.38 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  28.38 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  27.78 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  26.29 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  22.79 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  23.83 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  42.03 
 
 
142 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  33.66 
 
 
130 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  34.26 
 
 
142 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  41.43 
 
 
141 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
133 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  35.29 
 
 
142 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  33.66 
 
 
130 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  43.28 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  34.62 
 
 
142 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  37 
 
 
141 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  39.13 
 
 
144 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  39.71 
 
 
154 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  40 
 
 
155 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  35 
 
 
127 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  35.9 
 
 
134 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
137 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  38.03 
 
 
138 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  41.54 
 
 
131 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  35.53 
 
 
135 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  37.63 
 
 
142 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 
144 aa  52.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  37.14 
 
 
142 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  35.53 
 
 
146 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  19.91 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  38.03 
 
 
143 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  35.53 
 
 
135 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  34.21 
 
 
135 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  37.68 
 
 
150 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  38.57 
 
 
143 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.77 
 
 
472 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>