100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02966 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
280 aa  583  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  66.06 
 
 
279 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  37.23 
 
 
279 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  37.67 
 
 
603 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
308 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  39.86 
 
 
296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  38.01 
 
 
607 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  35.54 
 
 
305 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  38.03 
 
 
284 aa  175  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  39 
 
 
298 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 
285 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 
285 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  34.88 
 
 
275 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  37.26 
 
 
309 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
278 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  35.36 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  36.68 
 
 
301 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
295 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  32.3 
 
 
320 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  36.33 
 
 
282 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
287 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  33.08 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 
333 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  31.03 
 
 
294 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 
322 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  35.06 
 
 
276 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
284 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  32.27 
 
 
276 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  30.9 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  33.75 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.72 
 
 
320 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
308 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.26 
 
 
323 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  30.11 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  30.19 
 
 
301 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 
301 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
349 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  28.32 
 
 
299 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  26.39 
 
 
248 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.44 
 
 
243 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  23.64 
 
 
307 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  24.32 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  24.32 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  24.32 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  24.32 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  23.94 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
249 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  22.14 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25.82 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  25.28 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.89 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  25.28 
 
 
244 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.3 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  23.69 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
244 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
244 aa  45.8  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3041  hypothetical protein  24.91 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0696  ribonuclease Z  24.61 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.44 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  20.46 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  25.6 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  24.91 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  24.91 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  23.76 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  19.35 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  30.43 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  19.35 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  24.54 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2899  hypothetical protein  24.53 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  20.46 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  20.49 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  27.78 
 
 
309 aa  42.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  24.54 
 
 
244 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  24.01 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  19.37 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  19.03 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  19.03 
 
 
307 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  19.03 
 
 
307 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  19.03 
 
 
307 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  19.03 
 
 
307 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>