19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02961 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02961  putative transposase  100 
 
 		 259 aa  541  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000274404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  99.24 
 
 		 831 aa  279  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  97.71 
 
 		 883 aa  275  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  97.71 
 
 		 992 aa  275  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  50.4 
 
 		 1006 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  32.06 
 
 		 1015 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  29.84 
 
 		 929 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 		 1028 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 		 1026 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 		 1026 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 		 1028 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  28.35 
 
 		 1018 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  27.72 
 
 		 1010 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  27.72 
 
 		 1010 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  28.72 
 
 		 1008 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  27.72 
 
 		 1009 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  27.72 
 
 		 1009 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  27.72 
 
 		 1009 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  27.72 
 
 		 1009 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>