More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02949 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  75.54 
 
 
468 aa  699    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  99.14 
 
 
467 aa  932    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  100 
 
 
503 aa  1023    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  70.02 
 
 
547 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  76.34 
 
 
468 aa  706    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  70.66 
 
 
561 aa  634    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  69.81 
 
 
547 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  71.67 
 
 
562 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  70.84 
 
 
561 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  70.84 
 
 
561 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  70.84 
 
 
561 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  70.84 
 
 
561 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  70.91 
 
 
564 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  70.91 
 
 
564 aa  628  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  69.81 
 
 
561 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  70.63 
 
 
561 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  70.63 
 
 
561 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  70.39 
 
 
562 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  70.41 
 
 
561 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  69.94 
 
 
565 aa  622  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  69.46 
 
 
561 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  69.89 
 
 
560 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  69.76 
 
 
561 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  68.47 
 
 
562 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  59.4 
 
 
551 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  59.27 
 
 
479 aa  552  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  57.02 
 
 
550 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  58.23 
 
 
552 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  59.36 
 
 
541 aa  524  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  54.74 
 
 
479 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  48.94 
 
 
550 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  45.07 
 
 
546 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  46.67 
 
 
546 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  44.86 
 
 
546 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  49.04 
 
 
548 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  45.64 
 
 
767 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  45.25 
 
 
475 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  47 
 
 
767 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  44.64 
 
 
745 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  46.24 
 
 
546 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.88 
 
 
473 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  44.85 
 
 
479 aa  364  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  45.32 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  44.75 
 
 
481 aa  352  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  45.78 
 
 
476 aa  349  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  45.78 
 
 
476 aa  349  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  45.78 
 
 
476 aa  349  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  44.89 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  42.41 
 
 
480 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  43.07 
 
 
482 aa  329  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  43.37 
 
 
474 aa  326  6e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  42.95 
 
 
474 aa  324  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  43.71 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  42.98 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  41.04 
 
 
457 aa  316  8e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  39.08 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  39.24 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  39.92 
 
 
468 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  40.13 
 
 
468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.45 
 
 
469 aa  309  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  42.76 
 
 
557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  42.5 
 
 
477 aa  299  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  39.91 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.65 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  36.77 
 
 
464 aa  276  5e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  38.56 
 
 
484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.9 
 
 
484 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  34.56 
 
 
453 aa  266  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.33 
 
 
456 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  34.45 
 
 
460 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  34.06 
 
 
484 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  35.79 
 
 
448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  34.89 
 
 
516 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.04 
 
 
722 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  33.26 
 
 
449 aa  250  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.31 
 
 
482 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.82 
 
 
466 aa  249  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.75 
 
 
717 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.33 
 
 
722 aa  247  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.34 
 
 
716 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  35.24 
 
 
716 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  34.43 
 
 
507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  32.39 
 
 
460 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.48 
 
 
462 aa  243  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.8 
 
 
484 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.73 
 
 
459 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1392  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.85 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  33.12 
 
 
717 aa  240  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.84 
 
 
471 aa  239  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  33.83 
 
 
515 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.79 
 
 
482 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  35.41 
 
 
720 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  32.37 
 
 
485 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  33.12 
 
 
738 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  34.32 
 
 
507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  35.32 
 
 
722 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.56 
 
 
470 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.73 
 
 
459 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  32.89 
 
 
511 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>