19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02948 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02948  alkylmercury lyase  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  90.91 
 
 		 211 aa  397  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0164  alkylmercury lyase  44.88 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.581292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  40.59 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  39.32 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  38.81 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0319  alkylmercury lyase  39.01 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  37.95 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2330  alkylmercury lyase  31.37 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0726495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2647  Alkylmercury lyase  40.45 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  27.32 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1769  alkylmercury lyase  35.77 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1768  alkylmercury lyase  34.15 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.628119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  28.07 
 
 		 767 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4942  alkylmercury lyase  23.84 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0286842  normal  0.02099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  26.19 
 
 		 767 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2087  alkylmercury lyase  33.64 
 
 		 133 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.302578  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  26.83 
 
 		 745 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>