37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02936 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  326  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  69.17 
 
 		 155 aa  203  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  53.9 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  53.9 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  53.9 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  53.9 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  50.68 
 
 		 155 aa  160  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  53.19 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  53.19 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  53.19 
 
 		 149 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  52.48 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  51.45 
 
 		 148 aa  157  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  52.41 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  52.55 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  52.94 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  54.68 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  49.28 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  48.63 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  48.85 
 
 		 148 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  49.06 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  50.93 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  50.52 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  50.52 
 
 		 143 aa  94  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  35.71 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  34.69 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  39.33 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  34.91 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  34.26 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  33.8 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0639  hypothetical protein  28.77 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00823182  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  27.78 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  25.77 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>