180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02909 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02909  probable methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2224  putative methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 		 418 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0659  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116739  normal  0.867777 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1323  conserved hypothetical protein, putative formyltransferase  34.36 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0072434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  26.94 
 
 		 314 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0208  methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  28.83 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491531  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  26.52 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3097  hypothetical protein  27.04 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  30.67 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1534  methionyl-tRNA formyltransferase  28.71 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  28.22 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0236  methionyl-tRNA formyltransferase  24.7 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2096  hypothetical protein  27.18 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0619627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  30.5 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  25.97 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  24.04 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  29.45 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0093  methionyl-tRNA formyltransferase  27.87 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  25.29 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0133  methionyl-tRNA formyltransferase  27.87 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  28.22 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0105  methionyl-tRNA formyltransferase  27.87 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  26.5 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  23.98 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  29.7 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  29.79 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  24.19 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  25.14 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  25.85 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02899  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  25.74 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0140158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  21.79 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  28.95 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  27.33 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  26.67 
 
 		 311 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07970  methionyl-tRNA formyltransferase  30.69 
 
 		 317 aa  52.8  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.152933 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  24.46 
 
 		 302 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  29.94 
 
 		 319 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  28.22 
 
 		 314 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  23.12 
 
 		 309 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  25.97 
 
 		 307 aa  52.4  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  24 
 
 		 336 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1729  methionyl-tRNA formyltransferase  26.58 
 
 		 301 aa  51.6  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0506  methionyl-tRNA formyltransferase  25.64 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  26.26 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  27.39 
 
 		 301 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  24.84 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  24.89 
 
 		 307 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  29.57 
 
 		 312 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0366  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 		 336 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  26.34 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  22.22 
 
 		 327 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2291  methionyl-tRNA formyltransferase  27.04 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  22.95 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  24.5 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  24.64 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  23.84 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  28.78 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  24.42 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  24.71 
 
 		 314 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  28.04 
 
 		 314 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  25.58 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  21.08 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  22.96 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  22.55 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  22.55 
 
 		 310 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  27.97 
 
 		 327 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1712  methionyl-tRNA formyltransferase  28.32 
 
 		 318 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  22.11 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  19.89 
 
 		 331 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  28.24 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  26.09 
 
 		 317 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0383  methionyl-tRNA formyltransferase  23.56 
 
 		 303 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  22.22 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  28.28 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  22.16 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2246  methionyl-tRNA formyltransferase  23.93 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155767  hitchhiker  0.00775212 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  22.22 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  26.53 
 
 		 314 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  26.28 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  23.39 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  26.55 
 
 		 314 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  24.43 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  24.05 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  24.43 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  27.12 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  21.43 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>